| contributor |
Laboratoire Instruments et Mesures, Université Ibnou Zohr d'Agadir, Faculté des Sciences, B.P 28/S, Agadir
|
| Laboratoire de Neurobiologie des Canaux Ioniques, Université d'Aix Marseille II, Faculté de Médecine de Marseille, Bd Pierre Dramard, 13916 Marseille
|
| Laboratoire de Cancerologie Experimentale, Université d'Aix Marseille II Faculté de Medecine de Marseille, Bd Pierre Dramard, 13916 Marseille
|
| creator |
AFDEL (K.)
|
| JOVER (E.)
|
| PALMARI (J.)
|
| BANOUNI (M.)
|
| date |
2005-07-22T09:44:54Z
|
| 2005-07-22T09:44:54Z
|
| 1999
|
| |
| description |
Quantitative estimation of one dimensionnal autoradiography film density profiles that are generated in gel electrophoresis of
radioactive proteins and nucleic acids is a very used approach . Several studies have been realized on this subject . They operate
on the optical density values acquired by CCD cameras . These operations include smoothing of mesuring values, background
correction, and integration of peak areas after sided fit of half gaussian profile to each band . Our contribution consists to validate
this approach by its application to separate RNA fragments of very close size. We show that is possible to use this approach to
evaluate directly the relative expression level of each RNA in a determined experiance configuration .
|
| L'estimation quantitative des autoradiogrammes par une somme de gaussiennes est une approche très utilisée. Elle est rendue possible grâce au développement des méthodes densimétriques utilisables après digitalisation de l'image d'autoradiographie du gel. La métrologie apportée par l'analyse et le traitement d'images permet d'éliminer les appréciations subjectives visuelles et humaines. Plusieurs études ont été réalisées sur ce sujet. Notre contribution consiste à valider cet approche par son application à des fragments d'ARN de tailles très proches. Nous montrons qu'il est possible d'évaluer directement par le calcul le niveau d'expression d'ARN dans une configuration d'expérience déterminée, évaluation très difficile à obtenir par d'autres méthodes.
|
| format |
52628 bytes
|
| application/pdf
|
| identifier |
Traitement du Signal [Trait. Signal], 1999, Vol. 16, N° 2, p. 157-162
|
| 0765-0019 |
| language |
en_US
|
| publisher |
GRETSI, Saint Martin d'Hères, France
|
| rights |
http://irevues.inist.fr/IMG/pdf/Licence.pdf
|
| source |
Traitement du Signal [Trait. Signal], ISSN 0765-0019, 1999, Vol. 16, N° 2, p. 157-162
|
| subject |
Electrophorèse gel
|
| Autoradiographie
|
| Traitement image
|
| Analyse image
|
| Réduction bruit
|
| Profil bande spectrale
|
| Densitométrie
|
| Fragment nucléotidique
|
| Séparation
|
| Courbe Gauss
|
| title |
5 - Validation de la méthode d'approche d'électrophorègramme par une somme de gaussiennes
|
| Validation of the approach method of electropherogram by a sum of gaussians
|
| type |
Article
|